По итогам работы лицензионной и аттестационной комиссий Омский государственный университет путей сообщения первым среди вузов железнодорожного транспорта признан успешно прошедшим повторную лицензионную экспертизу (приказ Рособрнадзора от 08.11.2006 № 2338) и на аккредитационной коллегии Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки, состоявшейся 09.11.2006, аккредитован вместе с филиалом в г. Тайге на следующий пятилетний срок.
В настоящее время ОмГУПС – динамично развивающийся университет, занимающий 36 место в рейтинге технических и технологических университетов России и имеющий сертификаты качества в ГОСТ Р, EVROCERT, OQS и IQNet.
